国家实施农村义务教育经费保障机制改革以来，解决或缓解了学校经费方面的困难，对推进农村义务教育发展，促进和谐社会建设起到了巨大作用。但在运行过程中，一些亟待解决的困难和问题仍需要我们不断思考和解决。
　　一、存在的问题：
　　1.资金来源单一，配套资金落实不到位，造成公用经费紧缺
　　除个别学校有其他收入(如幼儿园收的保育费等)外，绝大部分学校的收入，只有上级拨付的保学校正常运转的学杂费和公用经费。虽然公用经费落实了，学校有了收入，但激励教师积极工作的一些奖金和福利，代课教师和临工工资等资金不到位，这些属于个人支出范畴，不能从公用支出支取，这些支出又将如何落实。不能支出有些又必须支出，使得一些学校进行变通报销，造成学校保正常运转的公用经费严重不足。
　　2.旧习导致盲目支出、负债运营，学校预算难以正常实施
　　部分学校长期以来收支无计划，那些项目该支出？什么时间支出？那些项目不该支出？没有依据。长期形成的习惯，不制订科学详实的预算，支出随意性很大。由于不分轻重缓急盲目支出，有的甚至借债或欠债进行购置，造成严重的资不抵债，使学校经费严重不足，个别还会导致长期负债运营。这样在会计手中积压了大量的支出单据，学校编制预算时未考虑或支出额太大无法考虑，导致预算无法正常实施，学校也就很难正常运行。
　　3.部分会计业务素质较低，也是造成学校预算难以正常实施的重要原因　　3.加强学习和培训，努力提高会计的业务素质实施农村义务教育经费保障机制改革成败的关键是会计，只要培养出一批懂业务会管理的，会计才能确保此次改革的成功 。怎样才能提高会计的业务素质呢？
　　首先是转变观念，特别是校长的用人观，提高对会计务素质的要求。学校应该选择责任心强业务素质高的教师担任财务工作，加强业务学习，提高业务水平，做好会计工作。其次是严格要求，一方面要求各学校必须建立现金账，并保证日清月结；二方面要求会计懂业务会管理，当好校长的参谋和监督员；三方面要求会计认真参与编制汇总预算支出细目表，并在上报时严格执行；四方面要求会计积累经验，不仅编制出科学客观的学期预算，又要汇总出实事求是的学期决算。 　　三、改进建议：
　　1.要求学校制定财务制度，建立规范、科学的管理章程
　　指导各中、小学根据各自的实际情况，制定本校财务制度，细化支出范围与标准，建立规范、科学的管理章程，加强支出核算，提高预算准确度。
　　要求学校不仅要建立现金账，还必须建立物品采购登记台帐，建立健全物品验收、进出库、保管、领用制度，明确责任，严格管理，新进物品必须经过验收入库后才能领用，学期末应与学校办公用品预算细目表进行核对，保证帐帐、帐物一致。
　　2.增加学校周转金额，理顺前期债务，改变支出习惯，严格执行学期预算